Madenin Esrarı, mühendis James Starr'a gelen bir mektupla başlıyor. Yıllar önce tükendiği için kapanan bir kömür madeninin eski çalışanından gelen mektup Starr'ı eski günlere götürüyor ve geriye dönüp madenin geçmişini öğreniyoruz. Madenin görkemli günleri, yerin altında çalışan fakat işini çok seven adamlar, kömürün tükenmesiyle birlikte madenin kapatılması...
Yıllar sonra gelen mektup nedeniye James Starr tekrar madene gidiyor, eski ustabaşı Simon Ford'la buluşuyor ve -elbette- olaylar gelişiyor!
Sürükleyici bir konunun yanında İskoçya coğrafyası, kömür madenlerinin özellikleri, kömür türleri ile ilgili birçok bilgi veriyor Jules Verne...