'Sultan'ın Mührü'nün olay örgüsü, 1800'lü yılların İstanbul'unda geçer. Roman, boynunda, sultanın mührüyle süslenmiş bir pandantifin asılı olduğu İngiliz bir kadının cesedinin, Boğaz'ın kıyılarına vurmasıyla başlar Cinayet, bundan birkaç yıl önce boğularak öldürülen ve faili bulunamayan başka bir İngiliz kadının ölüm vakasını çağrıştırmaktadır. Sulh hakimi Kamil Paşa, bu olayın failini bulmakla görevlendirilir. Romanın kurgusu, Canan adlı Müslüman bir kadının öyküsüyle iç içe geçmiş bir halde verilir. 'Sultan'ın Mührü', olabildiğince duygusal ayrıntılar üzerine kurulur ve bu cinayet üzerinden çökmekte olan Osmanlı'nın politik ve toplumsal yaralarını işlemeyi amaçlar.